MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella henselae str. Houston-1 chromosome

Total Repeats: 12928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005956	T	7	7	3604	3610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005956	A	6	6	3625	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005956	A	7	7	3651	3657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005956	GGGGA	2	10	3670	3679	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005956	CGT	2	6	3695	3700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005956	AGG	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005956	TAT	2	6	3743	3748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005956	ACTA	2	8	3779	3786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_005956	GAAAA	2	10	3813	3822	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005956	A	6	6	3819	3824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005956	A	8	8	3867	3874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005956	AT	3	6	3882	3887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005956	T	6	6	3900	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005956	A	6	6	7769	7774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005956	T	6	6	7799	7804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005956	TTTA	2	8	8678	8685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005956	TGC	2	6	8707	8712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005956	TAT	2	6	8739	8744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005956	ATTT	2	8	8749	8756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005956	AATGAA	2	12	8803	8814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005956	TAG	2	6	8851	8856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005956	A	6	6	8865	8870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005956	ATT	2	6	8918	8923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005956	TTG	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005956	AAT	2	6	9060	9065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005956	T	6	6	9065	9070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005956	GAT	2	6	9146	9151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005956	TA	3	6	11080	11085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005956	A	7	7	11123	11129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005956	T	8	8	11137	11144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005956	TGAA	2	8	11178	11185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005956	A	7	7	11210	11216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005956	TG	3	6	11272	11277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005956	GA	3	6	11345	11350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005956	TAG	2	6	11359	11364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005956	ATG	2	6	11377	11382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005956	TTC	2	6	11494	11499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005956	ATA	2	6	11527	11532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005956	CT	3	6	11538	11543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005956	TAT	2	6	11552	11557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005956	AAG	2	6	11562	11567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005956	GGAA	2	8	11575	11582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005956	AT	3	6	11583	11588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005956	A	7	7	13888	13894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005956	TAA	2	6	13922	13927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005956	AG	3	6	13965	13970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005956	ACTT	2	8	13974	13981	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005956	ACA	2	6	13999	14004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_005956	CT	3	6	14620	14625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_005956	A	6	6	14633	14638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005956	T	7	7	14641	14647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005956	CA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005956	TACAT	2	10	14670	14679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_005956	AT	3	6	14678	14683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005956	A	6	6	14712	14717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005956	TG	3	6	15509	15514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005956	A	6	6	15517	15522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005956	TAA	2	6	15530	15535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005956	GAG	2	6	15545	15550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005956	A	6	6	15558	15563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005956	TCA	2	6	16965	16970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005956	TTAC	2	8	17021	17028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_005956	T	6	6	17134	17139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005956	ATT	2	6	17170	17175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005956	TTA	2	6	17203	17208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005956	AAG	2	6	17221	17226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005956	AGG	2	6	17246	17251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005956	TCT	2	6	17285	17290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005956	GTT	2	6	17311	17316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005956	T	7	7	17345	17351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005956	TTG	2	6	17377	17382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005956	A	6	6	17391	17396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005956	TCA	2	6	17399	17404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_005956	GGT	2	6	17411	17416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005956	GTT	2	6	17420	17425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005956	TTTG	2	8	17434	17441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005956	AATG	2	8	17486	17493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005956	AAG	2	6	17497	17502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005956	GTT	2	6	17514	17519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005956	TA	3	6	17526	17531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005956	ATA	2	6	17539	17544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005956	TCTCC	2	10	17549	17558	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_005956	AAC	2	6	17568	17573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005956	ATG	2	6	17580	17585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005956	TTG	2	6	17658	17663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005956	TA	3	6	17700	17705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005956	TCAGA	2	10	17706	17715	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_005956	TCA	3	9	17797	17805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_005956	AAAAGG	2	12	17857	17868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005956	ATT	2	6	17954	17959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005956	GAG	2	6	18001	18006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005956	ATG	2	6	18039	18044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005956	AAAT	2	8	18079	18086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005956	A	6	6	18103	18108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005956	TAT	2	6	18824	18829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005956	TGA	2	6	18892	18897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005956	AGGGT	2	10	18917	18926	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005956	AG	3	6	18945	18950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005956	ATAGT	2	10	18974	18983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005956	GGT	2	6	19042	19047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005956	GAA	2	6	19224	19229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005956	AG	3	6	19231	19236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005956	GTT	2	6	19275	19280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005956	ATA	2	6	19291	19296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005956	T	6	6	19338	19343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005956	AGA	2	6	19370	19375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005956	GTTT	2	8	19381	19388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005956	T	7	7	19503	19509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005956	TTA	2	6	19516	19521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005956	A	6	6	19525	19530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005956	T	6	6	19614	19619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005956	TTA	2	6	19635	19640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005956	AAG	2	6	19648	19653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005956	GAA	2	6	20205	20210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005956	A	6	6	22101	22106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005956	TA	3	6	22129	22134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005956	T	7	7	22139	22145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005956	T	9	9	22157	22165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005956	TGT	2	6	22196	22201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005956	A	7	7	22237	22243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005956	TAA	2	6	22246	22251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005956	A	6	6	22269	22274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005956	A	8	8	22278	22285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005956	GTA	2	6	22366	22371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005956	GTGC	2	8	22402	22409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_005956	GAA	2	6	22465	22470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005956	ATTTT	2	10	22481	22490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005956	T	6	6	22556	22561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005956	T	6	6	22714	22719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005956	TGA	2	6	22736	22741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005956	GAA	2	6	22771	22776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005956	TTTA	2	8	22820	22827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005956	A	8	8	22835	22842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005956	TC	4	8	22969	22976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_005956	ATTT	2	8	22983	22990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005956	TTTA	2	8	23073	23080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005956	AAT	2	6	23095	23100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005956	ATGA	2	8	23166	23173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005956	ATTG	2	8	23195	23202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005956	TGAA	2	8	23230	23237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005956	ACTT	2	8	23298	23305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_005956	GTG	2	6	23323	23328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005956	AG	3	6	23348	23353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005956	ATG	2	6	23423	23428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005956	TGG	2	6	23460	23465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005956	TTAAG	2	10	23479	23488	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005956	TAT	2	6	23499	23504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005956	GCAG	2	8	23537	23544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_005956	ATA	2	6	23671	23676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005956	AAATT	2	10	23715	23724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_005956	TAT	2	6	78290	78295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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